不过,当年有暴乱亲历者投书指出,暴乱期间至少有三名印尼华人曾向中国大使馆求助,但使馆人员询问得知他们是“WNI”(Warga Negara Indonesia,印尼公民)后便拒绝提供帮助。印尼学者廖建裕、中国学者查道炯、新西兰学者杜建华、新加坡学者徐本钦等皆指出,暴乱期间中国政府无意为受害的印尼华人提供救援和保护。在5月排华暴动之前,许多印尼以外的华人就批评中国政府应该保护印尼华人,然而北京拒绝进行干预,因为当时北京和雅加达的关系已经相当融洽,北京不想破坏这种关系。有中国驻美外交官私下表示,中国政府不可能向印尼提出抗议或派遣船只,因为在印尼的大部分华人都是印尼公民,因此没有充分理由这样做。5月排华暴乱的严重时期,北京的态度也没有改变。中国政府确实有对在印尼工作和旅行的中国公民采取撤侨措施,并为寻求帮助的台湾和澳门旅行证件持有者提供领事保护,但与之有别的是,中国政府并不愿意介入印尼华人的命运。在公开和正式场合,雅加达的事务都不是北京的关注点。北京政府将华人称为“印尼家庭的一分子”,并没有义务保护他们。临近六四天安门事件周年日或许是北京政府保持低调的原因之一,因为他们担心中国学生的民族主义情绪会被激起,给中共中央总书记江泽民为首的中共领导层带来压力,特别是5月排华暴行或许会重新唤醒人民对六四屠杀的回忆。